Seminaire 2019
L’association BioInfoDiag a organisé un séminaire de trois jours pour réunir la communauté. Le séminaire a eu lieu du 18 au 20 septembre 2019 sur le campus médecine de Rouen.
Il a réuni un peu plus de 70 personnes répartis sur les trois jours :
- 25 participants à la formation
- 58 participants aux conférences
- 22 participants à l’assemblée générale de l’association
Formation : Intégration continue et déploiement continu sous gitlab
Mercredi 18 septembre 2019 – Medical Training Center
- 14h00 – Découverte CI/CD gitlab
- 15h00 – Mise en oeuvre, travaux pratiques
- 16h00 – Pause
- 16h15 – Mise en place d’un pipeline de tests
- 18h00 – Fin de la formation
Journée scientifique BioInfoDiag
Jeudi 19 septembre 2019 – Amphi 110, Bât Stewart
- 09h00 – Accueil
- 09h15 – Présentation du séminaire
- 09h30 – Yannis Duffourd : Les technologies SHD de 3ème génération
- 10h00 – Émilie Aït Yahya : Différences entre les génomes de référence et gene models
- 10h30 – Sofia Papadimitriou : The oligogenic determinism and machine learning
- 11h15 – Pause
- 11h45 – Dominique Vaur : Tour d’horizon du diagnostic lié à BRCA
- 12h15 – Table ronde : rôle des bioinformaticiens dans le diagnostic
- 13h00 – Repas
- 14h30 – Chadi Saad : Les outils de virtualisation Docker/singularity
- 15h00 – Alban Lermine : Les pipelines d’analyse SeqOIA
- 16h00 – Table ronde : Archivage des données brutes, quelles pratiques ?
- 16h30 – Pause
- 17h00 – Gaël Nicolas : L’interprétation de variants
- 17h30 – Table ronde : Les outils d’aide à l’interprétation de variants
- 18h30 – Fin de la journée
- 19h30 – Repas de gala à l’atelier Claude Monet
Assemblée générale de l’association
Vendredi 20 septembre 2019 – Amphi 110, Bât Stewart
- 10h00 – Accueil
- 10h30 – Assemblée Générale de l’association
- 12h00 – Fin du séminaire
- 12h15 – Repas (à emporter si nécessaire)
