Seminaire 2019

L’association BioInfoDiag a organisé un séminaire de trois jours pour réunir la communauté. Le séminaire a eu lieu du 18 au 20 septembre 2019 sur le campus médecine de Rouen.

Il a réuni un peu plus de 70 personnes répartis sur les trois jours :

• 25 participants à la formation
• 58 participants aux conférences
• 22 participants à l’assemblée générale de l’association

Formation : Intégration continue et déploiement continu sous gitlab

Mercredi 18 septembre 2019 – Medical Training Center

• 14h00 – Découverte CI/CD gitlab
• 15h00 – Mise en oeuvre, travaux pratiques
• 16h00 – Pause
• 16h15 – Mise en place d’un pipeline de tests
• 18h00 – Fin de la formation

Journée scientifique BioInfoDiag

Jeudi 19 septembre 2019 – Amphi 110, Bât Stewart

• 09h00 – Accueil
• 09h15 – Présentation du séminaire
• 09h30 – Yannis Duffourd : Les technologies SHD de 3ème génération
• 10h00 – Émilie Aït Yahya : Différences entre les génomes de référence et gene models
• 10h30 – Sofia Papadimitriou : The oligogenic determinism and machine learning
• 11h15 – Pause
• 11h45 – Dominique Vaur : Tour d’horizon du diagnostic lié à BRCA
• 12h15 – Table ronde : rôle des bioinformaticiens dans le diagnostic
• 13h00 – Repas
• 14h30 – Chadi Saad : Les outils de virtualisation Docker/singularity
• 15h00 – Alban Lermine : Les pipelines d’analyse SeqOIA
• 16h00 – Table ronde : Archivage des données brutes, quelles pratiques ?
• 16h30 – Pause
• 17h00 – Gaël Nicolas : L’interprétation de variants
• 17h30 – Table ronde : Les outils d’aide à l’interprétation de variants
• 18h30 – Fin de la journée
• 19h30 – Repas de gala à l’atelier Claude Monet

Assemblée générale de l’association

Vendredi 20 septembre 2019 – Amphi 110, Bât Stewart

• 10h00 – Accueil
• 10h30 – Assemblée Générale de l’association
• 12h00 – Fin du séminaire
• 12h15 – Repas (à emporter si nécessaire)