Le séminaire

L’association BioInfoDiag organise un séminaire de trois jours pour réunir la communauté. Le séminaire aura lieu du 18 au 20 septembre prochain sur le campus médecine de Rouen.

Programme

Mercredi 18 septembre 2019 – Medical Training Center

Formation : Intégration continue et déploiement continu sous gitlab

  • 14h00 – Découverte CI/CD gitlab
  • 15h00 – Mise en oeuvre, travaux pratiques
  • 16h00 – Pause
  • 16h15 – Mise en place d’un pipeline de tests
  • 18h00 – Fin de la formation

Le soir, un repas convivial sera proposé en fonction du nombre de participants.

Le Medical Training Center se situe au 20 rue Marie Curie, 76000 Rouen


Jeudi 19 septembre 2019 – Amphi 110, Bât Stewart

  • 09h00 – Accueil
  • 09h15 – Présentation du séminaire
  • 09h30 – Yannis Duffourd : Les technologies SHD de 3ème génération
  • 10h00 – Alban Lermine : Les pipelines d’analyse SeqOIA
  • 10h30 – Pause
  • 11h00 – Émilie Aït Yahya : Différences entre les génomes de référence et gene models
  • 11h30 – Table ronde : Le rôle des bioinformaticiens dans le diagnostic
  • 12h30 – Repas
  • 14h00 – Chadi Saad : Les outils de virtualisation Docker/singularity
  • 14h30 – Non-confirmé : Intégrité des données et sécurité informatique
  • 15h00 – Table ronde : Archivage des données brutes, quelles pratiques ?
  • 16h00 – Pause
  • 16h30 – Dominique Vaur : Tour d’horizon du diagnostic lié à BRCA
  • 17h00 – Gaël Nicolas : L’interprétation de variants
  • 17h30 – Table ronde : Les outils d’aide à l’interprétation de variants
  • 18h30 – Fin de la journée
  • 19h30 – Repas de gala à l’atelier Claude Monet

Vendredi 20 septembre 2019 – Amphi 110, Bât Stewart

  • 10h00 – Accueil
  • 10h30 – Assemblée Générale de l’association
  • 12h00 – Fin du séminaire
  • 12h15 – Repas (à emporter si nécessaire)

Le bâtiment Stewart se situe au 12 Rue du Faubourg Martainville, 76000 Rouen